Основан Михайловский собор был в 1108 году, Киевским князем Святополком Изяславовичем и назван им в честь святого архистратига Михаила. А поскольку главная церковь монастыря была оформлена и украшена очень богато, а купола ее были щедро позолочены, то в народе собор сразу именовали Златоверхим. По окончании строительства храма в 1113 году в нем было предано земле тело самого Святополка, и, таким образом, с начала 12 века Михайловский собор становится княжеской усыпальницей. Позже здесь были также похоронены сыновья Владимира Мономаха Андрей и Святослав.

Однако самой главной святыней были мощи святой великомученицы Варвары. Гробница, в которой они хранились, в свою очередь, стояла в центре собора на чугунном возвышении, огражденном решеткой. Первоначально гроб был кипарисовым, а в 1694 году гетман Иван Мазепа передал в монастырь раку, сделанную из серебра - непревзойдённый шедевр украинского ювелирного искусства.